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有许多方法，其中列出了一种或两种：
1。
不同的粘性端无法连接。所以，如果我们想连接，我们需要删除不同的粘性端和连接平端。
有两种方法可以将粘性端变为平端：Klenow酶或S1核酸酶。
为了减少载体自连接，碱性磷酸酶可用于治疗载体。
最后，将载体与目的基因连接，构建重组质粒。
[2.
设计引物，用其自身的限制性位点扩增目标基因。直接改变目的基因的限制性位点，用与载体相同的限制性内切酶对目的基因进行酶切，切出相同的粘端。
目标基因与载体直接连接。
1. PCR扩增目的基因片段，需要设计引物，选择同源序列，根据质粒载体和基因序列选择限制性位点，纯化PCR产物。2根据引物设计的限制性位点对PCR产物和质粒载体进行酶切，酶切产物应回收利用。三。PCR产物与质粒载体通过连接酶连接。4将连接产物转化到受体菌（通常为dh5a）中，包被培养过夜。如果T载体上没有限制性位点，则应重新设计具有限制性位点的引物。PCR扩增后，将T载体酶切后与表达载体连接。如果T载体上有必要的限制性位点，则直接限制后可恢复目的片段并连接到表达载体上。
如果需要扩增特定的基因片段并将其插入载体中构建质粒，则应根据载体上多克隆位点的限制性位点在目标基因片段的上下游设计一个序列，并将载体上的限制性位点引入载体中设计的顺序。
此时，设计用于完成PCR扩增并在目标序列的上游和下游引入限制性位点的两个序列称为质粒构建引物。这样，扩增得到的目的片段两端就有酶切位点。酶切后与载体连接，载体经酶切后形成环，完成质粒的构建。
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